Das Historische Museum Frankfurt ist seit 1954 in fünf historischen Gebäuden am Römerberg untergebracht, zu denen auch das älteste Bauwerk Frankfurts, die ehemalige Saalhofkapelle aus der Stauferzeit (um 1120) gehört. Diese Altbauten wurden im Rahmen einer umfassenden Neukonzeption des Museums saniert und restauriert. Seit ihrer Wiedereröffnung im Mai und August 2012 sind hier neu gestaltete Dauerausstellungen zu besichtigen.

In den architektonischen Fragmenten der Königsburg aus dem 12./13. Jahrhundert wird die Frankfurter „Stauferzeit“ wieder lebendig. Die Ausstellung „Mainpanorama“ im Rententurm widmet sich dem Leben und Handel am Main seit dem Beginn der Neuzeit.

Im neoromanischen Burnitzbau werden auf vier Etagen in der Ausstellung „Frankfurter Sammler und Stifter“ herausragende Konvolute von zwölf bürgerlichen Frankfurter Sammlerpersönlichkeiten aus dem 17. bis 20. Jahrhundert präsentiert.

Die Frankfurter „Stadtmodelle“, darunter das berühmte Altstadtmodell der Brüder Treuner aus den Jahren 1925 bis 1961, werden im Obergeschoss des Bernuspalais’ gezeigt. Dort ist auch die „Bibliothek der Alten“, ein offenes Archiv von Frankfurter Autoren, das jedes Jahr um einen Beitrag wächst, präsentiert.

Mit der geplanten Eröffnung des Neubaus am Römerberg (anstelle des abgerissenen, 1972 eröffneten Museumsneubaus) im Jahr 2017 wird der Umbau des Museums beendet sein.

Das Kinder Museum an der Hauptwache und die Caricatura (Museum für Komische Kunst) im Leinwandhaus bieten wechselnde Ausstellungsprogramme.